40 年未解的"细胞穹窿",被 Claude 拽进结构生物学视野

Anthropic 11 月 5 日宣布,旗下生物学团队借 Claude,首次把原核 Vault(穹窿颗粒)三维结构解析出来。这种囊泡状复合物自 1986 年被发现,四十年没人说清它在活细胞里究竟干什么;人类细胞内的同类单细胞内近万。

破局靠大海捞针:团队在 150 亿条预测序列里翻找同源物,从 29 个细菌门与 4 个古菌门锁定候选,挑 44 个送实验室验证。7 个在大肠杆菌中组装成穹窿样颗粒,电镜确认 4 个完整结构。其中噬菌体 L05 分辨率达 3.2 埃——96 条相同蛋白链、每条 7 个壁重复序列(人类是 9 个),颗粒 54.5×47.5 纳米、偏球形,内部体积比人类大 25%。团队再塞入额外壁序列,变体体积又增约 20%,证明壁序列数量能调尺寸。

Claude 把纯化从 3 天压到 90 分钟,也添过乱

Claude 身兼数职:蛋白搜索、DNA 设计、纯化优化、电镜数据处理都有它。传统纯化 3 天,新方案砍到 90 分钟;首个完整结构模型 34 小时生成,老办法得数周。

AI 也露了怯:它建议的添加剂曾干扰 DNA 递送,让研究白等两周;电镜处理时跳过标准步骤,产出不准的图,靠密集监督才纠回。结构虽已解析,穹窿功能依旧成谜。L05 及变体数据已存入蛋白质数据库,为货物封装提供尺寸可调的支架——人机协作既提速,也提醒模型远未到独当一面。

via AI新闻资讯 (author: AI Base)
 
 
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